MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506996
2	NC_013198	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506996
3	NC_013198	GCATCA	2	12	267	278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258506996
4	NC_013198	CGATGA	2	12	285	296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258506996
5	NC_013198	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506996
6	NC_013198	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
7	NC_013198	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258506996
8	NC_013198	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
9	NC_013198	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258506996
10	NC_013198	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258506996
11	NC_013198	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258506996
12	NC_013198	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
13	NC_013198	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
14	NC_013198	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
15	NC_013198	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
16	NC_013198	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258506996
17	NC_013198	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
18	NC_013198	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
19	NC_013198	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506996
20	NC_013198	A	6	6	1265	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	258506996
21	NC_013198	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506996
22	NC_013198	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013198	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013198	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013198	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013198	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013198	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506997
28	NC_013198	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
29	NC_013198	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
30	NC_013198	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	258506997
31	NC_013198	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506997
32	NC_013198	CGTTGC	2	12	2042	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
33	NC_013198	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
34	NC_013198	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506997
35	NC_013198	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258506997
36	NC_013198	CTG	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
37	NC_013198	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
38	NC_013198	GTG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506997
39	NC_013198	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506997
40	NC_013198	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013198	T	6	6	2733	2738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013198	GT	3	6	2767	2772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013198	ATC	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013198	AT	3	6	2873	2878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013198	TAGGC	2	10	2930	2939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013198	G	6	6	2999	3004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013198	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013198	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013198	TGG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013198	CGA	3	9	3149	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506998
51	NC_013198	CAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506998
52	NC_013198	TGAT	2	8	3221	3228	25 %	50 %	25 %	0 %	258506998
53	NC_013198	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506998
54	NC_013198	CGT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506998
55	NC_013198	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	258506999
56	NC_013198	GCAAG	2	10	3464	3473	40 %	0 %	40 %	20 %	258506999
57	NC_013198	GC	3	6	3510	3515	0 %	0 %	50 %	50 %	258506999
58	NC_013198	CAA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
59	NC_013198	GC	3	6	3567	3572	0 %	0 %	50 %	50 %	258506999
60	NC_013198	AATT	2	8	3616	3623	50 %	50 %	0 %	0 %	258506999
61	NC_013198	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
62	NC_013198	GATCG	2	10	3654	3663	20 %	20 %	40 %	20 %	258506999
63	NC_013198	TTTG	2	8	3707	3714	0 %	75 %	25 %	0 %	258506999
64	NC_013198	GCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
65	NC_013198	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
66	NC_013198	TGC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
67	NC_013198	CAA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
68	NC_013198	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
69	NC_013198	AGC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
70	NC_013198	GAT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
71	NC_013198	CAG	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
72	NC_013198	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506999
73	NC_013198	AGTTA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	20 %	0 %	258506999
74	NC_013198	GAT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
75	NC_013198	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
76	NC_013198	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013198	AAGA	2	8	4525	4532	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
78	NC_013198	GAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
79	NC_013198	AAGA	2	8	4546	4553	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
80	NC_013198	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507000
81	NC_013198	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
82	NC_013198	CAT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
83	NC_013198	TTGAAG	2	12	4730	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
84	NC_013198	GAT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
85	NC_013198	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
86	NC_013198	GGT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
87	NC_013198	TGGCGG	2	12	4866	4877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258507000
88	NC_013198	CGG	2	6	4890	4895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
89	NC_013198	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
90	NC_013198	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
91	NC_013198	GAGCAT	2	12	5038	5049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258507000
92	NC_013198	CCGGAT	2	12	5071	5082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258507000
93	NC_013198	TGA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
94	NC_013198	GCG	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
95	NC_013198	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
96	NC_013198	GAA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
97	NC_013198	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
98	NC_013198	GGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
99	NC_013198	GAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
100	NC_013198	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
101	NC_013198	AGACCA	2	12	5570	5581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258507000
102	NC_013198	GGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
103	NC_013198	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507000
104	NC_013198	GCT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
105	NC_013198	AAG	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
106	NC_013198	ACA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
107	NC_013198	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
108	NC_013198	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
109	NC_013198	CCGATG	2	12	6053	6064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258507000
110	NC_013198	GTT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
111	NC_013198	GCC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
112	NC_013198	ATG	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
113	NC_013198	GCC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
114	NC_013198	GCCA	2	8	6295	6302	25 %	0 %	25 %	50 %	258507000
115	NC_013198	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507000
116	NC_013198	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
117	NC_013198	GAA	2	6	6433	6438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
118	NC_013198	TTG	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
119	NC_013198	AAC	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
120	NC_013198	GAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013198	GAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
122	NC_013198	ACGT	2	8	6649	6656	25 %	25 %	25 %	25 %	258507001
123	NC_013198	ATGA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	258507001
124	NC_013198	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
125	NC_013198	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
126	NC_013198	TGACGG	2	12	6878	6889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258507001
127	NC_013198	GCG	3	9	6891	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
128	NC_013198	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
129	NC_013198	GATT	2	8	6968	6975	25 %	50 %	25 %	0 %	258507001
130	NC_013198	GTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507001
131	NC_013198	GC	3	6	7023	7028	0 %	0 %	50 %	50 %	258507001
132	NC_013198	CTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
133	NC_013198	ACC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
134	NC_013198	CCG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
135	NC_013198	ATC	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507001
136	NC_013198	CCA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
137	NC_013198	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
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143	NC_013198	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
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177	NC_013198	AAAAT	2	10	9652	9661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_013198	GGTA	2	8	12881	12888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_013198	CAT	2	6	13618	13623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507010
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254	NC_013198	AT	3	6	13874	13879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_013198	TA	3	6	13928	13933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_013198	ATTTG	2	10	13937	13946	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013198	AGG	2	6	13967	13972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013198	TCGG	2	8	14191	14198	0 %	25 %	50 %	25 %	258507011
259	NC_013198	TCT	3	9	14221	14229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507011
260	NC_013198	TTC	2	6	14358	14363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507011
261	NC_013198	CAT	2	6	14375	14380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507011
262	NC_013198	GC	3	6	14417	14422	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
263	NC_013198	ATT	2	6	14478	14483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507011
264	NC_013198	CG	4	8	14535	14542	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
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266	NC_013198	CGG	2	6	14624	14629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507011
267	NC_013198	CAG	2	6	14638	14643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507011
268	NC_013198	GCG	2	6	14682	14687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507011
269	NC_013198	GAT	2	6	14757	14762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507011
270	NC_013198	GCC	2	6	14769	14774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507011
271	NC_013198	ACA	2	6	14821	14826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507011
272	NC_013198	GAA	2	6	14936	14941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507011
273	NC_013198	ATT	2	6	15040	15045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507011
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278	NC_013198	CG	3	6	15409	15414	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
279	NC_013198	GAA	2	6	15444	15449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507011
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291	NC_013198	TGTT	2	8	15857	15864	0 %	75 %	25 %	0 %	258507012
292	NC_013198	GCC	2	6	15876	15881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507012
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296	NC_013198	A	6	6	16051	16056	100 %	0 %	0 %	0 %	258507012
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302	NC_013198	CAT	2	6	16425	16430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507012
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312	NC_013198	CA	3	6	16808	16813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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339	NC_013198	ACTTG	2	10	18291	18300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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343	NC_013198	GTA	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
344	NC_013198	TGA	2	6	18474	18479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_013198	AGCAG	2	10	18868	18877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
352	NC_013198	ATG	2	6	18954	18959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
353	NC_013198	ATT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_013198	GTA	2	6	19446	19451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507016
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380	NC_013198	ATAC	2	8	20016	20023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
381	NC_013198	ATG	2	6	20233	20238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
382	NC_013198	TTG	2	6	20317	20322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
383	NC_013198	A	6	6	20359	20364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_013198	TGT	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_013198	GTC	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_013198	TTGAT	2	10	20548	20557	20 %	60 %	20 %	0 %	258507017
387	NC_013198	A	6	6	20600	20605	100 %	0 %	0 %	0 %	258507017
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391	NC_013198	CGA	2	6	20743	20748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507017
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393	NC_013198	AG	3	6	20873	20878	50 %	0 %	50 %	0 %	258507017
394	NC_013198	ATCA	2	8	20988	20995	50 %	25 %	0 %	25 %	258507017
395	NC_013198	GCT	3	9	21140	21148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507017
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397	NC_013198	CGC	2	6	21295	21300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507017
398	NC_013198	AGC	2	6	21424	21429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507017
399	NC_013198	CG	3	6	21524	21529	0 %	0 %	50 %	50 %	258507017
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401	NC_013198	CTT	2	6	21615	21620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507017
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438	NC_013198	TTTA	2	8	23019	23026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_013198	AAT	2	6	23044	23049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_013198	TTG	2	6	23181	23186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507019
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